Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rnpc3Q3UZ01 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms