Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms