Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms