Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pfdn4Q3UWL8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pfdn4Q3UWL8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pfdn4Q3UWL8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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