Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn13Q3UW68 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms