Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr1d1Q3UV55 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms