Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms