Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28047Q3US59 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms