Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rtl4Q3URY0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms