Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Mindy4Q3UQI9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mindy4Q3UQI9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Mindy4Q3UQI9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mindy4Q3UQI9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms