Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ05

Bpifb5, BPI fold-containing family B, member 5, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifb5Q3UQ05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bpifb5Q3UQ05 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bpifb5Q3UQ05 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bpifb5Q3UQ05 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bpifb5Q3UQ05 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bpifb5Q3UQ05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms