Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SbsponQ3UPR9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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