Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms