Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc4Q3UP44 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms