Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp3Q3ULW8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms