Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms