Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms