Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nom1Q3UFM5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nom1Q3UFM5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms