Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE31

Uncharacterized protein KIAA0930 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UE31 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3UE31 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3UE31 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3UE31 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3UE31 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3UE31 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms