Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atxn7l3bQ3UD01 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atxn7l3bQ3UD01 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms