Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms