Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rnf180Q3U827 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Rnf180Q3U827 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Rnf180Q3U827 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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