Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf149Q3U2C5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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