Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pag1Q3U1F9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms