Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TraddQ3U0V2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TraddQ3U0V2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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