Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms