Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms