Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CiartQ3TQ03 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms