Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms