Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c3Q3TMP1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c3Q3TMP1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms