Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xlr4cQ3TKR2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms