Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hp1bp3Q3TEA8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms