Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDK6

Rogdi, Protein rogdi homolog, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RogdiQ3TDK6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RogdiQ3TDK6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms