Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl9Q32KG4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms