Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M3Q31093 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms