Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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