Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo3bQ1EG27 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo3bQ1EG27 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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