Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Rpusd2Q149F1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd2Q149F1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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