Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lingo4Q149C3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lingo4Q149C3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lingo4Q149C3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lingo4Q149C3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lingo4Q149C3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lingo4Q149C3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms