Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntnap5bQ0V8T8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5bQ0V8T8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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