Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h18Q0P678 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms