Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms