Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc45a4Q0P5V9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms