Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrioQ0KL02 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms