Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NeblQ0II04 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms