Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Padi2Q08642 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Padi2Q08642 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms