Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn2Q08093 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms