Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MestQ07646 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MestQ07646 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms