Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NrepQ07475 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NrepQ07475 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NrepQ07475 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms