Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms